Approche permettant de quantifier un nombre restreint de protéines simultanément, en suivant plusieurs peptides spécifiques pour chaque protéine (SRM, PRM). Ces méthodes sont plus spécifiques et sensibles que les approches globales et nécessitent des développements pour chaque protéine cible.

> Recherche fondamentale et/ou clinique
> Modifications post-traductionnelles
> Caractérisation et validation de biomarqueurs

> Protéine identifiable par LCMSMS (expérience pilote nécessaire)
> Nombre suffisant de peptides spécifiques pour la protéine d’intérêt

> Multiple reaction monitoring (MRM)
> Parallel reaction monitoring (PRM)