• Description / Workflow

    Quantification basée sur 

    > des approches sans marquage (Label-free) : les échantillons sont analysés indépendamment par LC-MS. Cette approche nécessite de nombreux réplicats et repose sur la stabilité et reproductibilité du système nanoLC-MS,

    > des marquages isotopiques : on introduit un marqueur de masse contenant des isotopes lourds, au niveau des peptides par marquages isobariques (TMT/iTRAQ) ou métaboliques au niveau des protéines (SILAC). Les échantillons peuvent être rassemblés et analysés simultanément.

    prestaWF protQuanti

  • Applications

    > Recherche fondamentale et/ou clinique
    > Etude des variations d'un protéome

  • Pré-requis / Contraintes

    > Choix du design expérimental (label-free, SILAC, TMT,…) guidé par le type d’échantillons (cultures cellulaires, tissus…), leur complexité et la quantité de matériel à disposition.
    > Nombre d’expérience suffisant pour un pré-traitement statistique.
    > Spectromètre de masse à haute résolution.

  • Technologies

    > Label-free
    > Marquage chimique (TMT/iTRAQ)
    > Marquage métabolique (SILAC)

Button Title

Plateaux :

FPP

MSPP

PP2I

PPC-CHU

Aller au haut